Град Пещера има стара и интересна история, която води своето начало от дълбока древност. С течение на хилядолетия този край е населяван от траки, славяни, българи, минали през влиянието на гърци, македонци, римляни и османци. За първи заселници в района са считани тракийското племе беси. В средновековието населението се е занимавало предимно със земеделие, скотовъдство и рудодобив.
По време на османското владичество жителите на Пещера участват в хайдушкото движение и националноосвободителните борби. Историята на града е събрана в богата експозиция от над 8000 експоната, разкриващи живота в различните периоди. В близост до Пещера са разположени китните исторически градчета Батак и Брацигово, центрове на знакови исторически събития.
Пещера има добре развита икономика, като няколко са големите заводи в града: “Биовет” – завод за антибиотици и лекарства, “Винпром Пещера” – завод за вино и високоалкохолни продукти и много обувни фабрики.